ScienceAdvances——[14.136]
①用高盐饮食（HSD）喂养黑色素瘤荷瘤小鼠，能诱导NK细胞介导的肿瘤免疫、延长生存，伴随PD1表达下调、IFNγ和血清马尿酸盐上调；②低盐饮食能增强非最佳剂量的抗PD-1治疗的抗肿瘤效果；③抗生素处理会削弱HSD的抗肿瘤作用，移植HSD喂养小鼠的粪菌能恢复与NK细胞功能相关的肿瘤免疫；④机制上，HSD提高双歧杆菌丰度，同时增加肠道通透性，导致双歧杆菌移位至肿瘤内，从而增强NK细胞功能；⑤瘤内注射双歧杆菌能活化NK细胞，从而抑制肿瘤生长。
高盐饮食（HSD）能调节T细胞功能，促进自身免疫病中的组织炎症。然而，HSD对肿瘤免疫的影响，以及肠道菌群在其中的作用，尚不清楚。ScienceAdvances近期发表研究，在小鼠模型中进行了探索了，发现HSD能通过调节肠道菌群来诱导NK细胞介导的抗肿瘤免疫，双歧杆菌可能在其中有关键作用。这些发现或为癌症治疗带来新启示。（@mildbreeze）
【原文信息】
High-saltdietmediatesinterplaybetweenNKcellsandgutmicrobiotatoinducepotenttumorimmunity
2021-09-10,doi:10.1126/
刘占举+李明松：丁酸抑制中性粒细胞功能，改善肠炎GutMicrobes——[10.245]
①丁酸显著抑制IBD患者中性粒细胞生成促炎细胞因子、趋化因子和钙卫蛋白；②丁酸通过抑制HDAC来抑制中性粒细胞产生促炎介质；③丁酸还抑制患者中性粒细胞的迁移、减少中性粒细胞胞外诱捕网（NETs）的形成；④RNA测序分析表明，丁酸对IBD中性粒细胞的免疫调节作用涉及白细胞的激活、固有免疫反应的调节和氧化应激反应；⑤口服丁酸通过抑制中性粒细胞促炎介质和NETs形成，显著改善DSS诱导的小鼠结肠炎的肠粘膜炎症反应。
上海市第十人民医院刘占举、广州医科大学附属第三医院李明松与团队，近期在GutMicrobes发表研究，报道了菌群代谢产物丁酸对炎症性肠病（IBD）患者的中性粒细胞的免疫调节作用，以及对结肠炎模型小鼠的保护性作用，并揭示了相关生物学机制，为治疗IBD提供了新见解。（@mildbreeze）
【原文信息】
Microbiotametabolitebutyrateconstrainsneutrophilfunctionsandamelioratesmucosalinflammationininflammatoryboweldisease
2021-09-08,doi:10.1080/19490976.2021.1968257
陈卫+李明锟+陆文伟：主食、民族、城市化等因素如何影响中国人的肠道菌群NPJBiofilmsandMicrobiomes——[7.29]
①分析中国8个民族、28个省份、63个市县的2678名健康志愿者的粪便菌群；②中国人群的菌群中厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门和放线菌门丰度最高，聚类可分为四种肠型：普氏菌属富集、拟杆菌属富集、埃希氏菌属富集型、混合型；③地理因素可最多地解释菌群差异，以小麦为主者相比以大米为主食者，有更多的S-腺苷-L-甲硫氨酸生物合成或葡聚糖-1,3-β-葡萄糖苷酶的基因；④城市化会降低个体内多样性、增加个体间多样性，并增加拟杆菌属肠型比例。
江南大学的陈卫院士、陆文伟和中国科学院北京基因组研究所李明锟与团队在NPJBiofilmsandMicrobiomes上发表的一项最新研究，对我国不同地区、不同民族的2678名健康志愿者的粪便菌群进行分析，同时收集记录地理、人口、饮食、城市化、生活方式和采样月份等信息，鉴定出了中国人群肠道菌群的4种肠型，并分析了地理区域、主食类型及城市化等不同因素对肠道菌群的影响。（@szx）
【原文信息】
Chinesegutmicrobiotaanditsassociationswithstaplefoodtype,ethnicity,andurbanization
2021-09-06,doi:10.1038/s45-0
昆明理工大学：帕金森病猴模型的肠道菌群及代谢产物特征NPJBiofilmsandMicrobiomes——[7.29]
①A53T转基因恒河猴表现出早期帕金森病症状，包括焦虑及认知障碍；②A53T转基因恒河猴的肠道菌群多样性更高，Sybergistetes、Akkermansia及迟缓埃格特菌的丰度高于对照猴，而普氏菌属减少；③A53T转基因恒河猴肠道中的甘油酸、L-天冬氨酸、对羟基苯乙酸水平显著高于对照猴，而肉豆蔻酸及3-甲基吲哚的水平降低；④A53T转基因恒河猴的代谢通路中，GAPDH及氧化磷酸化反应显著增加，可能导致线粒体负荷的增加。
昆明理工大学的司维、郑云和季维智与团队在NPJBiofilmsandMicrobiomes上发表的一项最新研究，开发了一种可表现出焦虑及认知障碍等早期帕金森病症状的A53T转基因恒河猴模型，并对其肠道菌群及代谢产物进行了分析。（@szx）
【原文信息】
Gutmicrobiotaandmetabolitesofα-synucleintransgenicmonkeymodelswithearlystageofParkinson'sdisease
2021-09-02,doi:10.1038/s42-3
抗生素使用时长不影响抗生素耐药基因的丰度EBioMedicine——[8.143]
①纳入45名使用抗生素进行治疗的患者（23名使用抗生素7天，22名使用抗生素14天）及11名对照；②在第30天，使用抗生素7天的患者与使用抗生素14天的患者的抗生素耐药基因丰度无显著差异；③相比于对照，患者的粪便细菌多样性及聚类无显著差异，但在第14天，患者的粪便菌群物种多样性显著降低；④相比于对照及使用抗生素7天的患者，在治疗期间及治疗后，使用抗生素14天的患者的粪便噬菌体含量显著降低。
来自EBioMedicine上发表的一项前瞻性队列研究结果，对45名接受抗生素治疗的患者及11名对照的粪便菌群及耐药组进行分析，发现抗生素使用时长（7天或14天）并未影响抗生素耐药基因的丰度，也不影响肠道菌群的多样性，但可能影响肠道噬菌体的含量。（@szx）
【原文信息】
Effectsofantibioticdurationontheintestinalmicrobiotaandresistome:ThePIRATERESISTANCEproject,acohortstudynestedwithinarandomizedtrial
2021-09-01,doi:10.1016/
酿酒酵母CNCMI-3856的多靶向益生特性GutMicrobes——[10.245]
①采用TIM-1和M-SHIME（使用6名健康人的粪样）肠道模型，研究益生酿酒酵母CNCMI-3856与产肠毒素大肠杆菌ETECH10407的互作；②CNCMI-3856在两种系统中均不直接抑制ETEC的生长；③但可造成ETEC细胞膜损伤，抑制其黏附及定殖因子、肠毒素相关基因表达以及降低肠毒素水平；④M-SHIME系统中，CNCMI-3856改善肠道菌群结构，提高不同生境乳杆菌及双歧杆菌丰度，并防御ETEC感染；⑤CNCMI-3856处理刺激结肠短链脂肪酸及回肠乙醇产生。
Gutmicrobes上发表的文章，采用TIM-1和M-SHIME两种不同的肠道模型研究益生酿酒酵母CNCMI-3856的抗产肠毒素大肠杆菌（ETEC）特性和机理。（@好雨）
【原文信息】
Multi-targetedpropertiesoftheprobioticCNCMI-3856againstenterotoxigenic(ETEC)H10407pathogenesisacrosshumangutmodels
2021-08-25,doi:10.1080/19490976.2021.1953246
衰老对消化道不同部位菌群的影响GutMicrobes——[10.245]
①收集3个年龄段的59名中老年（40-85岁）健康人的唾液、粪便以及上、下消化道（UGIT、LGIT）样本，对腔内和黏膜相关菌群组成的变化进行全面表征；②菌群组成表现出强烈的个体间变异，UGIT、LGIT和粪便样本之间有明显的区别；③衰老对菌群的影响从唾液到UGIT再到LGIT不断增强，而粪便菌群受衰老的影响较小；④因此在研发改善衰老的菌群干预方法时，应纳入黏膜菌群的数据，而不能仅依靠粪便菌群数据。
【原文信息】
Impactofhealthyagingonactivebacterialassemblagesthroughoutthegastrointestinaltract
2021-08-30,doi:10.1080/19490976.2021.1966261
国内团队：好好吃饭能降低大肠癌风险FrontiersinNutrition——[6.576]
①饮食因素是结直肠癌死亡和DALY率的主要原因，其分别可解释全球结直肠癌死亡和DALYs的32%和34%，全谷物、牛奶、钙的低摄入和红肉高摄入是疾病负担的主要饮食风险因素；②从1990至2019年，与饮食相关的结直肠癌的死亡人数和DALYs增加了一半，男性的年龄标准化死亡率等ASRs指标均高于女性；③由于饮食风险，亚洲尤其是东亚的结直肠癌负担最高，中国一直是饮食风险导致的结直肠癌死亡人数和DALYs最高的国家，其次是美国、印度和日本。
【原文信息】
DietaryRisk-RelatedColorectalCancerBurden:EstimatesFrom1990to2019
2021-08-24,doi:10.3389/
国内团队Cell子刊：CRISPR引导的细菌靶向遗传筛选系统CellReports——[9.423]
①ShCAST系统介导的转座子筛选是一种强大而可靠的必需基因鉴定方法；②Cas12k引导的转座酶介导微生物中的位点特异性转座；③本研究使用Cas12k引导的转座酶开发了基因组工程方法STAGE，可用于基因型-表型关系的高通量分析；④在铜绿假单胞菌和肺炎克雷伯菌为材料的的实验中，实现了高通量的突变体构建；⑤该研究的亮点还包括基于STAGE的转录因子突变文库的生成，必需基因和抗生素抗性相关因素的鉴定。
近日，中山大学骆观正课题组与上海科技大学季泉江课题组合作，在CellReports期刊发表了题为“TargetedgeneticscreeninginbacteriawithaCas12k-guidedtransposase”的研究论文，开发了名为Site-specificTransposon-AsistedGenomeEngineering(STAGE)的新方法，该方法允许在多种微生物（例如铜绿假单胞菌和肺炎克雷伯菌）中进行高通量的Cas12k介导的基因敲除筛选。（@刘永鑫-中科院-宏基因组）
【原文信息】
TargetedgeneticscreeninginbacteriawithaCas12k-guidedtransposase
2021-08-31,doi:10.1016/
的创作者：mildbreeze，王新宇，Johnson，szx，EchoQuasimodo，陈彬林，刘永鑫-中科院-宏基因组
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