(1)50×TAEBuffer():调节pH值至8.5,定容至1L,室温保存。
(2)LB液体培养基(800mL):称量8g氯化钠,4g酵母提取物和8g胰蛋白胨,加入去离子水,定容至800mL,高温高压蒸汽灭菌30分钟,置于4℃冰箱保存。
(3)抗生素Ampicillin:称量1g的Ampicillin粉末,加入一定量的灭菌超纯水,充分混匀溶解,定容至10mL,然后在超净台工作,用0.22μm过滤器过滤除菌,分装,-20℃冰箱保存。
(4)IPTG诱导剂:称量1g的IPTG粉末,加入一定量已灭菌的超纯水,充分混匀溶解,定容至10mL,然后在超净台工作,用0.22μm过滤器过滤除菌,分装,-20℃冰箱保存备用。

(5)PBS缓冲溶液:分别称量氯化钾0.2g,磷酸二氢钾0.2g,磷酸氢二钠2.08g,氯化钠8.0g,加入一定量的超纯水,使其充分搅拌溶解,定容至1L,高温高压蒸汽灭菌30分钟。
(6)Columnbuffer:20mL1M的Tris-HCl,11.7gNaCl,2的EDTA,用超纯水定容至1L。
(7)Elutionbuffer:10mM麦芽糖加入到Columnbuffer中。
(8)考马斯亮蓝R-250染色液:称量0.5g考马斯亮蓝R-250粉末并放置于烧杯中,添加250mL的异丙醇。
(9)5×Tris-甘氨酸缓冲液:称取,SDS5g,甘氨酸93.825g,溶于800mL超纯水中,定容至1L,实验前用超纯水将其稀释成1×备用。
(10)1.5mol/LTris()1.3mL,10%,10%过硫酸铵0.02mL,,上下颠倒充分混匀。
原核表达重组质粒的构建(1)利用生物软件设计PCR引物,并分别在上游引物5'端和下游引物3'端加酶切位点和pMal-c2X-NAP-S1、pMal-c2X-NAP-S2、pMal-c2X-NAP-S3和pMal-c2X-NAP-S4的基因PCR扩增所用引物见表。

以本实验室保存的重组质粒pET-24b-NAP为模板,分别按照常规PCR条件扩增NAP基因及S1、S2、S3、S4基因。在冰上配制PCR体系,混合均匀,离心,然后进行PCR操作。

在每个扩增的目的基因片段反应液中,取出5μL的PCR扩增产物,同时利用DNA产物纯化试剂盒对PCR反应扩增得到的产物进行产物纯化。
PCR扩增产物经过1%的琼脂糖凝胶电泳,验证后纯化PCR扩增产物。根据PCR产物纯化试剂盒将PCR产物纯化。利用PCR,采用目的基因NAP的上游引物及S1、S2、S3、S4的下游引物,以纯化的产物为模板。

将PCR产物进行凝胶电泳检测,对目的条带进行割胶回收,使用胶回收试剂盒胶回收NAP-S1、NAP-S2、NAP-S3、NAP-S4基因PCR产物。

培养:加入700μL的LB液体培养基(已预热至42℃),37℃、200rpm,振荡培养50分钟。涂布:3000rpm、3分钟离心浓缩菌体,弃上清至剩余液体200μL,重悬混匀,将其菌液均匀涂布于含Amp的LB平板上,37℃培养箱倒置培养16小时。
第二天,观察平板上的克隆情况,平板置于4℃冰箱保存。接种环挑取单菌落到加入3mL含有Amp的LB液体培养基的5mLEP管中,将其置于37℃的摇床上,转速150rpm,震荡培养6h,进行菌落PCR验证。PCR反应完成后用1%的琼脂糖凝胶电泳检测,选取有特异性条带的单菌落菌液进行后续验证。

选取菌落PCR验证正确的单菌落菌液,取70μL加入7mL含有Amp的LB液体培养基中,置于摇床中振荡培养过夜。按照说明书步骤,提质粒进行双酶切。双酶切体系置于37℃水浴锅中酶切3-6h,酶切完成后用1%的琼脂糖凝胶电泳验证。

参考Axygen质粒小提试剂盒说明书,提取空质粒pMal-c2X。
①提前一晚,挑取单克隆,添加千分之一Amp,在LB液体培养基中进行摇菌培养,37℃,200rpm,14h。
②移液枪共吸取5mL的菌液进行离心收集菌体,12000×g,1分钟,离心后弃上清。
③取置于4℃的试剂S1250μL,重悬菌体,吹打均匀,使其无块状菌体。
④加入试剂盒中试剂S2300μL,轻轻上下颠倒6-8次,裂解菌体3分钟。
⑤加入350μL的试剂盒中试剂S3,轻轻上下颠倒数次,然后离心12000×g,10分钟。
⑥小心吸取上清,转移至SpinColumn中,套入至2mL的离心管,离心12000×g,1分钟,弃滤液。
⑦移液枪吸取500μL的试剂W1加入SpinColumn内,12000×g,1分钟离心,弃去滤液。
⑧移液枪吸取700μL的试剂WashBufferW2加入SpinColumn内,12000×g,1分钟离心,弃去滤液。重复该步骤。
⑨12000×g,1分钟离心,然后将SpinColumn转入新的1.5mL离心管内,开盖静置5分钟,挥发乙醇,不宜时间过长,防止DNA遭到损坏。
⑩移液枪吸取40μL已经60℃预热的灭菌超纯水添加在SpinColumn滤膜中央处,室温静置2分钟,12000×g,1分钟离心洗脱。最终得到质粒,超微量核酸蛋白仪测定其质粒浓度,-20℃保存备用。

T4DNA连接酶和连接酶Buffer放置于冰上,向EP管中加入ddH2O、双酶切产物载体pMal-c2X和NAP-S1、NAP-S2、NAP-S3、NAP-S4基因,混匀,置于42℃水浴5分钟后,置于冰上,再加入T4DNA连接酶和连接酶Buffer,置于16℃条件下连接过夜。

连接后第二天进行转化,方法同上。
转化后第二天进行菌落PCR鉴定,方法同上。将鉴定正确的菌扩大培养并提质粒。
取上述步骤中提取的重组表达质粒pMal-c2X-NAP-S1、pMal-c2X-NAP-S2、pMal-c2X-NAP-S3、pMal-c2X-NAP-S4进行SalI和EcoRI双酶切鉴定。将双酶切体系置于37℃水浴2h。加入2μL10×LoadingBuffer后,进行1%的琼脂糖凝胶电泳检测。
将双酶切鉴定正确的pMal-c2X-NAP-S1、pMal-c2X-NAP-S2、pMal-c2X-NAP-S3、pMal-c2X-NAP-S4质粒送至金唯智有限公司进行测序,使用BLAST()比对测序结果,Chromas分析基因序列单峰图谱。

(1)将测序正确的阳性重组质粒pMal-c2X-NAP-S1、pMal-c2X-NAP-S2、pMal-c2X-NAP-S3、pMal-c2X-NAP-S4分别转化至原核表达菌株中。
(2)接种环挑取单克隆菌到含Amp的LB液体内培养,200×g,37℃过夜振荡培养。
(3)第二天以1:100比例接种于含有Amp的LB培养基,200×g,37℃进行扩大培养。利用分光光度计检测菌液OD600值。
(4)当其OD600达到0.6对数生长期,加入已配好的诱导剂IPTG进行诱导处理,使其诱导剂的终浓度为0.4mmol/L。200×g,37℃诱导培养4小时。
(5)9000×g,5min离心菌液,可溶性平衡缓冲液重悬沉淀,收集菌体,-20℃保存。
另外以(DE3)和pET24b空质粒作为阴性对照。SDS-LoadingBuffer处理样品,12%SDS-PAGE蛋白电泳分析其融合蛋白表达情况。

融合蛋白rMBP-NAP-S的表达形式与纯化分析
(1)挑取单克隆菌接种,200×g,37℃在含有Amp的LB液体培养基过夜振荡培养。
(2)第二天以1:100比例接种于含Amp的800mLLB液体培养基中,200×g,37℃进行扩大培养约3小时。当其OD600达到0.6对数生长期,加入已配好的诱导剂IPTG进行诱导处理,使其诱导剂的终浓度为0.4mmol/L。200×g,37℃诱导培养4小时。
(3)收集菌体:分装诱导表达后的菌液,离心弃上清,收集沉淀,加入适量已配好的Columnbuffer重悬菌体。
(4)超声破碎,设置超声细胞破碎仪的功率为150W,超声3秒,间歇3秒,共超声20分钟,其中每超声3分钟,冰浴2分钟,防止超声过热使蛋白变性,超声破碎完成,冻存于-20℃。
(5)表达形式分析,将超声破碎后的溶液进行低温离心,分别收集上清和沉淀,SDS-LoadingBuffer处理样品。制备10%SDS-PAGE蛋白胶,90V电泳,分析融合蛋白表达形式。
(6)用8倍柱体积的Columnbuffer平衡蛋白亲和层析柱,加入菌液上清并使其匀速流出,用12倍柱体积的Columnbuffer清洗柱子,以洗去与柱子不结合的杂蛋白。用Elutionbuffer洗脱目的蛋白,洗脱过程中使用考马斯亮蓝G-250检测蛋白含量,洗脱至考马斯亮蓝G-250溶液不变色为止。收集纯化产物,SDS-LoadingBuffer处理样品。制备10%SDS-PAGE蛋白胶,90V电泳,检测蛋白纯化结果。
融合蛋白rMBP-NAP-S透析浓缩
(1)经过SDS-PAGE鉴定正确后,将所得蛋白置于处理好的透析袋中,两端用细线系紧以防蛋白外漏,于PBS中4°C过夜透析。
(2)将变色硅胶置于微波炉中烘干使其充分干燥,把透析好的蛋白连同透析袋一起放在变色硅胶中,置于4°C密封过夜,透析结束后将蛋白转移至干净的离心管保存。
融合蛋白rMBP-NAP-S去除内毒素和浓度测定
实验具体方法参考厦门EtEraserTMHP内毒素去除试剂盒说明书和SolarbioBCA蛋白浓度检测试剂盒说明书。
(1)蛋白样品的处理。在蛋白样品上样前使用0.45μm的滤膜过滤处理蛋白溶液。
(2)活化柱子内交联的琼脂糖凝胶。组装完实验仪器后,添加试剂盒内已预冷的再生缓冲液至柱子内部进行活化,控制流速缓慢流出,每次添加5mL的缓冲液,一共三次。

(3)平衡亲和树脂。添加试剂盒内已预冷的平衡缓冲液,控制流速缓慢流出,每次添加6mL的缓冲液,一共三次。
(4)上蛋白样品。添加已预冷的蛋白溶液,控制流速缓慢流出,收集流出液。柱子使用保存液保存于4℃冰箱。
(5)配制BCA工作液和蛋白样品稀释。工作液应充分混匀,减少误差,蛋白样品取5倍和10倍进行稀释。
(6)标准品稀释作标准曲线。将标准品按照0、50、100、150、200、300、400、500ng/uL进行操作处理。
(7)孵育和读数。37℃培养箱孵育30分钟,酶标仪读取A562nm的数值,作出标准曲线从而计算得出蛋白样品的浓度。
参考文献
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